Fytofarmaká môžu, tak ako ostatné lieky, ovplyvniť chirurgický zákrok. Odborný časopis Journal of the American medical Association 2001, Vol. 286, Nr. 2, s. 208 –  216  uverejnil štúdiu týkajúcu sa tohto problému. Fytofarmaká môžu mať rôzne vplyvy na výsledok operácie. Napríklad užívanie chvojníka Ephedra vedie k poruchám frekvencie rytmu srdca, ginseng – spôsobuje hypoglykémiu, echinacea môže spomaľovať hojenie rán.

Fytofarmaká môžu spôsobiť zmeny  v účinku liekov podaných pred operáciou, preto je potrebné, aby pacient oznámil ošetrujúcemu lekárovi, ktoré  fytofarmaká užíva, tak ako je to pri syntetických liekoch. Treba ich  pred operáciou včas vysadiť a prestať užívať. Podľa výsledkov výskumu vedcov univerzity v Chicagu ide o tieto časové údaje:

Echinacea echinacea (Echinaceae): treba vysadiť čo najskôr, aj mesiac vopred,

chvojník – chvojník (Ephedra L.): najmenej 24 hodín pred zákrokom,

kava-kava – piepor opojný ( Piper methysticum L.): 24 hodín pred zákrokom,

cesnak – česnek (Allium sativum L.): všetky preparáty vynechať 7 dní pred zákrokom,

ľubovník bodkovaný – třezalka – (Hypericum perforatum L.: 5 dní)

ženšen (Panax ginseng): najmenej týždeň pred zákrokom.

Podľa mienky vedúcich spomínanej štúdie sa stáva zriedka, že sa lekár pýta na užívanie fytofarmák a pacient nevie, že fytofarmaká môžu byť potenciálne nebezpečné.

Deutsche Apotheker Zeitung 141, 2001, 29, 8/3398

RNDr. L. Súkeník